第三方仓储管理，指的是仓储系统的布局设计、货物的保存、仓储如何进行操作。它们性质不同却很相近。
一、仓储系统的布局设计
仓储系统有三大运输主要干线：铁路、公路和船舶。在区域内送货是主要地区，其他为副中心地区，这就形成了一个完整的布局系统模式，避免了复杂混乱的局面。枢纽顾名思义是配送中心，基地是仓库。与此同时还需要对配送中心的选址规划、仓储系统内的设施设备进行安排，规划好库存区域。
二、库存控制
仓库以仓储系统的布局设计为依据对本仓库的管理目标和管理模式进行确定。这样，才能确定仓库的商业模式。
（1）将控制目标定位在服务质量和运营成本上，控制库存的量，避免货量过多过少现象出现。
（2）服务质量、运营成本、计费系统、客户关系管理将会成为重要控制目标，实现企业利润最大化。
（3）物流仓储管理中库存控制有执行、反馈和分析。
三、仓储管理中的操作
仓储作业操作包括进仓、盘点、账务处理、出仓等，在第三方物流的仓储管理中，是以仓库管理系统为中心来进行主导管理。信息化管理对仓库控制的集成化起重要作用。
(1)进仓作业流程
首先是审核接收的单据，然后开始检查车辆，再卸货，验货，验收成功后系统指导上架，并对货品进行贴签扫描，单据处理后最后入账。
(2)盘点作业流程
制订盘点计划，然后盘点，对实物和标签核对，盘点表与系统账务进行复核，最后计算库存准确率。
(3)出仓作业流程
接单审单，然后把货品系统分配，分拣备货，发货，复核交接，单据处理，最后销账。
(4)账务处理
实时记录和检查进出库作业、质量状态、数量的改变；同时，对货品进行分类、整理、归档保存、备份相关凭证。