配送中心的作业流程是根据自身的特性、规模有所不同的。主要包括：进货、搬运、储存、盘点、订单处理、拣货、补货、出货、配送等。
1、进货
进货作业包括把货品做实体上的接收，从货车上将其货物卸下，并核对该货品的数量及状态(数量检查、品质检查、开箱等)，然后记录必要信息或录入计算机。
2、搬运
即将不同形态之散装、包装或整体之原料、半成品或成品，在平面或垂直方向加以提起、放下或移动，可能是要运送，也可能是要重新摆置物料，而使货品能适时、适量移至适当的位置或场所存放。在配送中心的每个作业环节都包含着搬运作业。
3、储存
储存作业的主要任务是把将来要使用或者要出货的物料做保存，且经常要做库存品的检核控制，储存时要注意充分利用空间，还要注意存货的管理。
4、盘点
货品因不断的进出库，在长期的累积下库存资料容易与实际数量产生不符，或者有些产品因存放过久、不恰当，致使品质功能受影响，难以满足客户的需求。为了有效的控制货品数量，需要对各储存场所进行盘点作业。
5、订单处理
由接到客户订货开始至准备着手拣货之间的作业阶段，称为订单处理，包括有关客户、订单的资料确认、存货查询、单据处理以及出货配发等。
6、拣货
每张客户的订单中都至少包含一项以上的商品，如何将这些不同种类数量的商品由配送中心中取出集中在一起，此即所谓的拣货作业。拣货作业的目的也就在于正确且迅速地集合顾客所订购的商品。
7、补货
补货作业包括从保管区域(Reserve Area)将货品移到拣货区域(Home Area)，并作相应的信息处理。
8、出货
将拣取分类完成之货品作好出货检查，装入合适的容器，做好标示，根据车辆趟次别或厂商别等指示将物品运至出货准备区，最后装车配送。
9、配送作业
配送是指将被订购之物品，使用卡车从配送中心送至顾客手中的活动。